オンラインストレージのBackblazeという会社が自社でのHDDの運用でのメーカーごとの信頼性を公表しています。
https://www.backblaze.com/blog/best-hard-drive/
メーカーによって壊れやすさは結構違うようです。
メーカーはHGST（昔の日立）、Seagate、WesternDigitalです。
Seagateで一部極端に悪い数字がありますね。
さて、今買うなら4TBでしょう。
ただ、WesternDigitalの４TBは高いから買ってないそうです。なのでデータなし。
HGSTとSeagateの勝負です。Seagateは過去の数字は悪いですが・・・
故障率、HGSTが1.4％、Seagateが2.6%。
というわけで買うならHGSTということになりそうです。
しかし、値段はどうなんでしょう？カカクコムで調べてみました。
HGSTの４TBだと0S03361でしょう。
http://kakaku.com/item/K0000323557/
最安値は¥17,144でした。（2015/01/23現在）
このHDDはCoolSpinといって回転数が可変だそうです。7200rpmのものよりは遅いでしょうけど、起動ドライブにしないのであれば問題ないと思います。
ましてや倉庫用としてはぴったりです。
つぎにSeageteです。
ST4000DM000が対抗馬です。
http://kakaku.com/item/K0000476098/
価格は¥15,258でした。（2015/01/23現在）
その差1,886円。実に微妙・・・
まぁどっちでも後悔はしないとは思いますが、この価格差であればHGSTを選択します、私なら。
ついでにWesternDigitalも。
WD40EZRX ¥15,645 http://kakaku.com/item/K0000577600/
WD40PURX ¥16,880 http://kakaku.com/item/K0000634628/
なにが違うのかというと、下の方は監視カメラの録画用に開発されたそうです。（プレスリリース参照）
これもまた微妙な価格差。